Inżynieria genetyczna

Biotechnologia

I stopnia

ogólnoakademicki

obowiązkowy

siódmy

chemia, biochemia, biofizyka, biologia molekularna, mikrobiologia

Tematyka realizowana podczas kursu ma na celu zapoznanie studenta z zaawansowanymi narzędziami i technikami pozwalającymi na klonowanie i ekspresję genów oraz metodami analizy genomów.

Rekombinacja DNA. Podstawowe narzędzia inżynierii genetycznej - enzymy restrykcyjne i modyfikujące ich zastosowanie, wektory, rodzaje wektorów i ich zastosowanie. Metody wprowadzania DNA do komórek. Analiza klonów, białka rekombinowane. „Biblioteki” DNA.PCR i techniki pokrewne, mutageneza. Metody stosowane w badaniach ekspresji genów i analizie sekwencji promotorowych. Zastosowanie wybranych metod analizy DNA w diagnostyce medycznej. Metody analizy genomu drożdżowego. Charakterystyka drożdży (gatunki, znaczenie, potencjał wykorzystania, budowa genomu). Zastosowanie S.cerevisiae i innych gatunków w produkcji obcych białek. Narzędzia wykorzystywane w transformacji drożdży (wektory, plazmidy, promotory, sekwencje regulatorowe, markery). Systemy reporterowe stosowane w badaniach interakcji białek i receptorów.

Obowiązkowa:

1. Biochemia Harpera, Murray R.K., Granner D.K., Mayes P.A., Rodwell V.W., PZWL (kolejne wznowienia od roku 2004).

2. Biochemia, Stryer L., PWN, wyd. V, 2005.

3. Biochemistry Voet S., Voet G. V., wyd. Villey & Son, kolejne wydania od roku 1990.

4. Biologia Molekularna (krótkie wykłady), Turner P.C., McLennan A.G, Bates A.D., White M.R.H., PWN, (kolejne wydania od roku 2004).

5. Terapia genowa, Szala S. Wyd. PWN, Warszawa 2003.

6. Przykłady analiz DNA, Słomski R., Wyd. Akademii Rolniczej im. A. Cieszkowskiego w Poznaniu, (kolejne wydania od r. 2004).

7. Genetyka molekularna Węgleński P. PWN, consecutive issues since 1995.

Uzupełniająca:

1. Publikacje naukowe (przeglądowe i prace oryginalne) opublikowane w ostatnich latach.

Po ukończeniu przedmiotu student

W zakresie wiedzy:

zna zasady planowania schematu klonowania genu do wybranego wektora/ wejściówki, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_WG01, NB_P6S_WG02, NB_P6S_WG05, NB_P6S_WG06;

zna kryteria doboru odpowiedniego wektora do klonowanego genu i wykonywanego eksperymentu oraz metody wprowadzania DNA do komórek bakteryjnych i eukariotycznych/ wejściówki, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_WG01, NB_P6S_WG02, NB_P6S_WG05, NB_P6S_WG06;

zna aktywności podstawowych enzymów modyfikujących i potrafi wybrać odpowiedni enzym do realizacji zamierzonego celu/ wejściówki, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_WG01, NB_P6S_WG02, NB_P6S_WG05, NB_P6S_WG06;

zna zasady wykonania zaawansowanych technik stosowanych w inżynierii genetycznej w analizie DNA/ wejściówki, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_WG01, NB_P6S_WG02, NB_P6S_WG05, NB_P6S_WG06;

W zakresie umiejętności:

potrafi samodzielnie wykonać izolację DNA, ocenę uzyskanego preparatu i jego elektroforezę/ obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW02, NB_P6S_UW03;

potrafi samodzielnie wykonać analityczną i preparatywną reakcję trawienia restrykcyjnego i ligacji oraz niezbędne obliczenia/obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW02, NB_P6S_UW03;

wykonać reakcję PCR, dobrać jej warunki do optymalnej amplifikacji analizowanej sekwencji oraz zaprojektować startery do reakcji PCR/obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW02, NB_P6S_UW03;

wykonać transformację bakterii/drożdży oraz wykonać analizę klonów/obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW02, NB_P6S_UW03;

zaproponować system do ekspresji białka i zgodnie z wyborem zaplanować schemat jego oczyszczania/obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW02, NB_P6S_UW03;

zinterpretować wyniki wykonywanych doświadczeń/obserwacja pracy na ćwiczeniach, kolokwium, sprawozdanie, egzamin/ NB_P6S_UW010;

W zakresie kompetencji społecznych:

jest gotów do oceny możliwości zastosowania technik klonowania genów w różnych dziedzinach nauki/ rozmowa podczas zajęć/ NB_P6S_KK01;

jest gotów do wykazania korzyści, jak i zagrożeń płynących z modyfikacji genetycznych różnych organizmów i wyrażania swojej opinii na ten temat/ rozmowa podczas zajęć/ NB_P6S_KK02, NB_P6S_KK03, NB_P6S_KK04;

jest gotów do współpracy w zespole, wykazania dbałość o dokładność wykonywanych przez siebie doświadczeń oraz powierzony specjalistyczny sprzęt laboratoryjny/ obserwacja pracy na ćwiczeniach/ NB_P6S_KK06.

ocena z ćwiczeń 50%, ocena z wykładu 50%