BIOINFORMATICS

Biologia

II stopnia

ogólnoakademicki

obowiązkowy

pierwszy

podstawy bioinformatyki

prof. dr hab. inż. Joanna Szyda joanna.szyda@upwr.edu.pl

prezentacja wybranych zagadnień z dziedziny bioinformatyki

bazy danych, równowaga Hardyego-Weinberga, współczynnik rekombinacji, analiza sprzężeń, analiza asocjacyjna, symulacje Monte Carlo, łańcuchy Markova, metody klasyfikacyjne

1. Barnes, M.R. (2007) Bioinformatics for Geneticists: A Bioinformatics Primer for the Analysis of Genetic Data. Wiley;

2. Xiong, J. (2011) Podstawy bioinformatyki, Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego

Po ukończeniu przedmiotu w zakresie wiedzy:

posiada wiedzę pozwalającą na interpretowanie zjawisk i procesów przyrodniczych w pracy badawczej i działaniach praktycznych

zna metodologię badań obowiązującą w naukach przyrodniczych

opisuje i wyjaśnia zjawiska biologiczne w kategoriach matematycznych

W zakresie umięjętności:

potrafi tworzyć bazy danych; do analizy danych, opisu zjawisk i testowania hipotez stosuje właściwe metody statystyki elementarnej i matematycznej oraz sprawnie wykonuje obliczenia, także przy wykorzystaniu pakietów statystycznych

na podstawie analizy zebranych danych formułuje i interpretuje wyniki wykonywanych zadań badawczych; umiejętnie zestawia je w tabelach i ilustruje graficznie; porównuje z innymi źródłami; wyciąga odpowiednie wnioski i formułuje odpowiednie sądy

wykazuje umiejętności krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych; tworzy i korzysta z baz danych bioinformatycznych; ocenia powiązania pomiędzy genami; prowadzi analizy genomu (analiza asocjacyjna), wykorzystuje algorytmy stosowane w bioinformatyce

W zakresie kompetencji społecznych:

jest chętny do systematycznej aktualizacji wiedzy z zakresu biologii i dyscyplin pokrewnych i świadomy potrzeby uczenia się przez całe życie

jest aktywny w podnoszeniu swoich kwalifikacji na drodze kursów i szkoleń specjalistycznych, a także studiowania specjalistycznego piśmiennictwa

potrafi inspirować i organizować proces uczenia się innych osób

Studentów posiadających zaliczenie ćwiczeń obowiązuje pisemny lub ustny egzamin (5-10 otwartych pytań) w sesji egzaminacyjnej. Egzamin pisemny trwa maksymalnie 90 minut. W czasie egzaminu student ma prawo do korzystania z notatek, lecz nie może komunikować się z innymi osobami. Jeśli egzamin nie zostanie zliczony w pierwszym terminie student ma prawo ponownie go zdawać ustnie lub pisemnie w terminie poprawkowym.